Wynagrodzenie za wykonanie badania Zamawianego musi zostać oszacowane na zasadach rynkowych. W związku z tym, jeśli kierownik badań kalkuluje koszty bezpośrednie (tj. wynagrodzenie, koszty podróży służbowych, materiały, surowce itd.), w kosztorysie powinien również uwzględnić narzut oraz zysk Uczelni. Usługa świadczona bez uwzględnienia zysku, może stanowić niedozwoloną formę pomocy publicznej, świadczoną na rzecz przedsiębiorcy. Z uwagi na zachowanie tajemnicy handlowej Uczelni, nie ujawniamy wysokości narzutu oraz zysku przedsiębiorcy. 

W przypadku zlecenia podwykonawcy części zadań, należy zadbać o przeniesienie pełni autorskich praw majątkowych do wytworzonych dóbr intelektualnych lub co najmniej w zakresie określonym w umowie pomiędzy Uczelnią a Zamawiającym. 

Współpraca badawcza pomiędzy Uczelnią a środowiskiem gospodarczym to nie tylko zlecenia komercyjne, gdzie zespół naukowy wykonuje zamówienie na konkretne badania na rzecz przedsiębiorcy, których najczęstszą konsekwencją jest przekazanie pełnych autorskich praw majątkowych Zamawiającemu. 

Środowiska te, mogą również wspólnie – w konsorcjum, ubiegać się dofinansowanie projektu. 

Przy wspólnym realizowaniu grantu badawczego, Uczelnia jest współwłaścicielem części wyników prac. W takim przypadku, na etapie negocjacji zapisów umowy konsorcjum, należy zadbać o interesy twórcy i Uczelni.